Анна-Виктория Балтруш родилась в Берлине в 1989 году.
В возрасте четырех лет она начала учиться игре на фортепиано и в возрасте девяти лет – на органе. Начиная с 2002 г. училась по классам фортепиано и органа в Университете Искусств в Берлине.
После его окончания в 2008 году продолжила обучение церковной музыке и игре на фортепиано в Высшей школе музыки в городе Фрайбург (по классу органа у профессоров М. Шмединга, З.Сатмари, Ф.Шампьона), где получила степень бакалавра в 2012 году и степень магистра в 2014 году. В настоящее время она заканчивает обучение на соискание диплома органного солиста.
Ещё будучи студентом, Балтруш была удостоена следующих известных призов и премий на престижных международных конкурсах: в 2009 году - первый приз на международном органном конкурсе Баховского общества в Висбадене; в 2010 - специальная стипендия Всенемецкого музыкального конкурса, в 2011 - второе место на 60-м Международном конкурсе ARD в Мюнхене; в мае 2013 - Первая премия на международном конкурсе органистов им. А. Риттера в Магдебурге; в июле 2013 - Вторая премия на Международном конкурсе органистов в Сент-Олбанс (Великобритания).
Анна-Виктория Балтруш регулярно выступает с сольными концертами по всей Германии, а также в Австрии, Швейцарии, Люксембурге, Испании, Великобритании, Турции и Словакии. Её сольный дебют в Берлинской Филармонии состоялся в январе 2012 года. В том же году она получила стипендию общества Брамса в Баден-Бадене.